与其它动物一样，适宜的饲养环境、良好的饮食以及常规的寄生虫控制将有助于将宠物爬行动物的疾病降至最低。
爬行动物的心脏和血管疾病
败血症由血液中的细菌引起，是爬行动物常见的死因。该病影响全身，可能由创伤、脓肿、寄生虫侵染或环境应激引起。死亡可能是突然发生的，也可能在出现长期的疾病迹象后发生。常见的症状包括呼吸困难、缺乏活力、抽搐和肌肉失控。患败血症的爬行动物腹部皮肤可能会出现微小的紫红色斑点；龟类的腹甲可能会发红。保持爬行动物环境清洁和维护良好可以降低败血症的风险。患病的爬行动物应被隔离，尽快由兽医诊治，并使用抗生素治疗。
爬行动物的消化系统疾病
爬行动物的消化系统可能会受到病毒、细菌、原虫和寄生虫感染的影响。
腺病毒
腺病毒可能会在某些蛇类（加蓬咝蝰、球蟒、红尾蚺、玫瑰蟒和锦蛇）、蜥蜴类（杰克逊变色龙、平原巨蜥和鬃狮蜥）以及鳄形类中引起致命的肝脏或消化道疾病。在鬃狮蜥中，腺病毒似乎通过粪口传播（粪便接触到口腔）。感染症状在较年轻的蜥蜴中更常见，但也可能影响成年蜥蜴，通常程度较轻。这些症状不明显，包括缺乏活力、虚弱、体重减轻、腹泻和突然死亡。幼年鬃狮蜥的发病率很高，但支持性护理（输液和辅助喂食）以及使用抗生素治疗继发性细菌感染可以提高存活率。
鬃狮蜥腺病毒感染的症状与由球虫和营养障碍引起的症状相似。腺病毒感染的诊断可以通过血液聚合酶链式反应 (PCR) 检测或肝脏活检来确诊。治疗以支持性治疗为主，包括使用抗炎药和辅助喂食。
从感染中康复的蜥蜴应至少隔离 3 个月。许多受感染的蜥蜴发育不良，并会罹患其他疾病。蜥蜴康复后能够感染其他蜥蜴的持续时间尚不清楚，因此您不应计划出售或交易先前受感染的动物。
传染性口炎
传染性口炎是口腔内膜组织的感染和炎症，常见于蛇类、蜥蜴类和龟类。早期症状包括口腔内出现微小的紫红色斑点。随着病情恶化，病变组织会沿着牙齿排列方向发展。在严重的情况下，感染可能会蔓延至上颌骨和下颌骨。口腔中常见的一些细菌是引起口腔炎最常见的原因。如果口腔炎未得到及时治疗，可能会发展为呼吸道或胃肠道感染。治疗包括通过手术清除口腔内的坏死组织、使用消毒液清洁、使用抗生素以及提供支持性护理。在严重的情况下，可能需要进行更广泛的手术。建议补充维生素（尤其是维生素 A 和 C），但可能无法改变疾病的病程。
肠道寄生虫
在人工饲养中处于应激状态并被关在小饲养箱里的宠物爬行动物，其对具有直接生命周期的寄生虫（也就是说，这些寄生虫只需要 1 个宿主种类（爬行动物）即可完成其生命周期）大量侵染的易感性会增加。必须尽一切努力清除爬行动物体内的寄生虫负荷，并清除环境中的中间宿主种类（如昆虫）。
兽医可以检测爬行动物的粪便以检查胃肠道寄生虫。当发现寄生虫侵染的证据时，应尝试进行治疗。通常需要使用驱虫药来消除体内寄生虫。有许多不同的驱虫药可供选择。兽医可以开具被认为对所涉及的特定寄生虫最有效的药物。
胃部蛔虫（胃蛔虫）常见于蜥蜴，在严重侵染时可引起胃溃疡。许多蛇类感染了一种生活在上消化道并会在附着部位造成创伤的钩虫。由对该钩虫的炎症反应引起的显著肿胀会导致肠梗阻。
被称为蛔虫（线虫）的寄生虫也经常感染爬行动物。受感染的蛇可能会出现严重的组织损伤，甚至死亡。感染蛔虫的蛇可能会吐出部分消化的食物或成虫，并且可能会食欲不振。感染可能会引起胃肠道内的炎性肿胀。这些肿胀可能会化脓并导致肠道穿孔。
在检查爬行动物的粪便时，可能会发现许多其他种类的线虫。在爬行动物吃掉受感染的动物后，在其粪便中也可能会看到猎物动物的寄生虫（如老鼠蛲虫），这些寄生虫不会在爬行动物中引起疾病。
原虫病
原虫是单细胞生物体；其中一些会导致动物患病。爬行动物侵袭阿米巴 (Entamoeba invadens) 是爬行动物最严重的致病性原虫。感染症状包括食欲不振和体重减轻、呕吐、含黏液或带血的腹泻以及死亡。该疾病可能在大型蛇类群体中快速传播。植食性爬行动物似乎比肉食性爬行动物更不易感。几种很少受累或死亡的爬行动物可以作为带虫者；这些动物包括束带蛇、北美黑游蛇和箱龟。大多数龟类具有抵抗力，尽管巨龟易感。其他具有抵抗力的种类包括东部王蛇、眼镜蛇（可能是使其能够捕食其他蛇类的适应性特征）和鳄鱼。易感蛇类包括大多数蚺蛇、游蛇科（包含王蛇、束带蛇和游蛇的一个科）、眼镜蛇科（包括珊瑚蛇和曼巴蛇等毒蛇科）、蝮亚科（蝮蛇，包括铜头蝮和响尾蛇）以及其他蝰蛇。该原虫通过摄入寄生虫的包囊形态而传播，该包囊随受感染蛇类的粪便排出，并在环境中长期存活。通过检查粪便或组织样本中的原虫来进行诊断。
通常开具抗原虫药物进行治疗。为了帮助防止爬行动物之间的传播，不应将龟类和蛇类同笼饲养。不应轻视该疾病传播给人类的潜在可能性，并应遵守严格的卫生和清洁措施。
隐孢子虫病是由各种隐孢子虫 (Cryptosporidium)原虫引起的感染。它可引起反流、明显体重减轻和长期虚弱。在蛇类中，该生物体会侵袭消化道内壁，导致胃壁增厚以及胃的正常消化运动丧失。兽医可能能够触及胃区的一个肿块。X 线检查，或者使用内镜对胃肠道内部进行检查和活检，可能会显示胃壁增厚。许多蜥蜴（包括旧大陆变色龙和草原巨蜥）主要在肠道受累。隐孢子虫病通过粪便或反流食物检测或胃活检来诊断。已经提出了几种治疗方法，但大多数方法效果不稳定。强化支持性治疗通常可稳定病情，并延长患病爬行动物的生存时间。
隐孢子虫病可在动物与人之间传播。然而，通常在爬行动物中发现的隐孢子虫种类似乎极少感染人类。
爬行动物的激素疾病
尽管激素（内分泌）疾病在爬行动物中似乎并不常见，但已有关于龟类发生 糖尿病（一种碳水化合物代谢障碍）的报道。这些爬行动物患糖尿病的迹象包括尿液中出现葡萄糖（一种糖）以及血液中葡萄糖水平异常升高。受累动物食欲可能增加但体重减轻。治疗较为困难，可能涉及胰岛素疗法、饮食调整以及处理并发疾病。
爬行动物的眼耳疾病
所有爬行动物都可能发生眼睛感染。耳部感染最容易发生于龟类。
眼脓肿与结膜炎
蛇类的眼镜膜（眼鳞，覆盖眼睛的透明保护膜）下方可能会形成脓肿。其他爬行动物可能会发生结膜炎，即眼周膜的炎症。结膜炎的严重程度从轻度到重度不等（累及眼周所有组织以及眼球本身）。它可能是由口腔内的传染性口炎蔓延所致。无眼镜膜的龟类和蜥蜴的结膜炎可以使用局部眼膏进行治疗。有眼镜膜的蛇类和蜥蜴需要通过手术引流脓肿并用抗生素溶液冲洗眼睛。一些受累的爬行动物，尤其是龟类，可能需要补充维生素 A。
耳部感染
耳部感染经常发生于龟类，最常见于箱龟和水龟。鼓膜处可见肿胀，并且可能存在病变组织。多种细菌均可引起耳部感染。患有中耳炎或内耳炎的动物通常需要进行手术，以穿刺鼓膜、冲洗中耳并清除受感染的组织。耳部感染也可能由维生素 A 缺乏引起，因此注射和饮食补充维生素 A 可能会有益。
爬行动物的骨骼和肌肉疾病
龟喙异常生长
喙异常生长发生于龟类。这种情况会妨碍进食，通常与营养不良、钙缺乏或两者兼有有关。钙或维生素 D3 缺乏可能导致头骨在发育过程中发生畸形。该畸形会干扰闭嘴时上下喙的正常定位，并可能影响喙的磨损。饮食中蛋白质水平过高可能会导致这种情况。治疗方法包括将喙修剪或磨成更正常的形状。由于颌骨潜在的异常位置，这种情况通常会复发，因此通常需要进行长期的、重复的喙修剪。应向圈养的龟类提供粗糙食物，以便在进食期间进行一些自然的喙塑形。
代谢性骨病
继发性营养性甲状旁腺功能亢进症是宠物爬行动物中最常见的骨病。此病是由钙磷比例失调、缺乏维生素 D3 的不良饮食，或饲养管理不当（缺乏紫外线 B 光、笼内温度控制不当）引起的。受累的爬行动物通常是快速生长的植食性和昆虫食性蜥蜴和龟类。体征包括食欲不振、虚弱、无法正常行走、颌骨或腿骨肿胀或畸形、脊柱或腿部骨折、泄殖腔脱垂（泄殖腔内膜通过排泄孔突出到体外）以及肌肉痉挛。诊断需要通过 X 线检查以记录骨骼的全身性骨丢失，并通过血液检查显示维生素 D 水平低以及钙磷失衡。危重病例的治疗需要液体疗法、营养支持，如果血钙水平过低还需注射钙剂。纠正饮食和饲养管理（包括提供紫外线以确保皮肤中合成充足的维生素 D）是成功治疗的最重要部分。
继发性肾性甲状旁腺功能亢进症是一种发生于成年爬行动物的肾脏疾病。此病与血液中高磷和低钙水平、肌肉和器官的异常钙化（硬化）以及骨骼钙丢失有关。虽然确诊需要证明肾功能不佳，或在肾脏活检中看到肾损伤，但可根据动物的病史、X 线检查和血液检查初步怀疑患有该病。由于纠正肾损伤困难，治疗选择有限，通常涉及使用药物和液体的支持性护理。
爬行动物的脑、脊髓和神经疾病
观星症是蛇类和其他爬行动物某些神经系统疾病的体征。观星症描述了一种颈部扭曲，使动物看起来像在向上看（朝向星星）。神经系统疾病的其他体征包括精神迟钝、姿势异常、癫痫发作以及无法正常移动。红尾蚺和蟒蛇发生观星症的最常见原因之一是包涵体病，该病由病毒感染引起。该疾病尚无治疗方法，且必定致死。
观星症也可由暴露于过高热量、头部受伤、毒素以及由细菌或其他生物体引起的感染所致。细菌性脑膜炎或脑炎可由进入血液并穿透神经系统组织的细菌感染引起。神经系统疾病的结局因病因而异，但预后通常较差。兽医将进行检查以试图确定神经系统体征的根本原因并开具适当的治疗方案。病毒性疾病通常采用支持性护理进行治疗。在细菌感染病例中通常需要使用抗生素。
爬行动物的营养性疾病
营养性疾病可由蛋白质、维生素和矿物质等各种营养素的饮食失衡引起，或由妨碍营养素正常代谢的疾病引起。
营养不良与脱水
食欲不振的爬行动物可能需要辅助喂食。这是一个最好由兽医指导的过程，因为给严重脱水的营养不良爬行动物喂食可能会导致其他健康问题。初始喂食应补充液体和电解质。脱水的体征包括皮肤松弛或眼球凹陷。
有时可以通过让脱水的爬行动物在保持该种类适宜温度范围内的饲养箱内的浅水中沐浴来鼓励其饮水。脱水的龟类也可能在沐浴时通过泄殖腔吸收水分。然而，脱水的爬行动物可能需要兽医通过注射或胃管给予液体。
营养不良的爬行动物可能会骨骼突出且面容消瘦，但营养不良和脱水的体征可能不易察觉。一些营养不良的动物需要辅助喂食，这应仅在兽医指导下进行以减少潜在风险。
如果爬行动物进食不好，应将温度、光照和湿度等环境因素设定为该类型爬行动物的适宜水平。如果环境条件不佳，爬行动物无法正常处理液体和营养素。
痛风
痛风可见于所有目的爬行动物。当血液中的尿酸水平过高时就会发生这种情况。据报道，痛风有两种形式。内脏痛风会累及器官，而关节痛风则会累及关节。X 线可能会显示受累器官和关节中由尿酸形成的矿化沉积物。内脏痛风可能是由于饮食中蛋白质过多（原发性内脏痛风）或脱水、肾脏损伤等其他原因（继发性内脏痛风）引起的。痛风会非常疼痛，带来的不适甚至会导致一些爬行动物拒绝移动、进食或饮水。
原发性内脏型痛风的治疗重点是纠正日粮组成。继发性内脏痛风通过尝试纠正潜在问题来治疗。如果尽早诊断，传统上用于治疗人类痛风的药物对爬行动物可能有效。然而，在晚期病例中，康复的前景较差。药物治疗通常必须是长期的，因为如果停药，痛风症状往往会复发。对于似乎感到疼痛且没有食欲的爬行动物，应考虑实施安乐死。
爬行动物的肺部和气道疾病
呼吸道感染（包括肺炎）在爬行动物中很常见，可由呼吸系统或全身寄生虫、不良的环境温度、卫生条件差、其他疾病、营养不良以及维生素 A 缺乏引起。张口呼吸、鼻部分泌物以及呼吸困难是常见的体征。在严重或病程较长的病例中，可能会发展为败血症（血液中的广泛感染）。治疗包括改善环境因素（如清洁度和温度）以及开始抗生素治疗。兽医将能够就适当的抗生素治疗向您提供建议。患有呼吸道感染的爬行动物应饲养在其首选温度范围的中高段。升高的温度有助于刺激免疫系统，也有助于稀释呼吸道分泌物，使其更容易被爬行动物排出。患肺炎的龟类通常伴有潜在的维生素 A 缺乏症。接受肺炎治疗的龟类可能无法完全康复，直到补充了维生素 A。
副粘病毒
副黏病毒感染在蝰蛇中比其他蛇类更常见，但在无毒蛇中也有报道。这种高度传染性的病毒最常引起呼吸系统问题。继发性细菌感染很常见，受感染的动物可能会出现鼻部分泌物、张口呼吸、口腔内有干脓液以及呼吸费力。有时会出现神经系统体征，例如震颤和异常姿势。该病毒似乎通过呼吸道分泌物从一只动物传播给另一只动物。
对典型治疗（包括抗生素）无反应的患有呼吸道感染的蛇可能感染了副黏病毒。血液检测可用于筛查动物感染情况，并防止携带者进入未感染的种群中。没有针对性的特异性治疗，但支持性护理和抗生素可能会有所帮助。受感染的蛇应予以隔离，并采取严格的卫生措施。
爬行动物的生殖系统疾病
难产（滞卵）
绝育手术在爬行动物中很少实施，因此生殖系统疾病仍然是一个常见问题。在卵生爬行动物中，卵（外壳矿化程度各不相同）可能会滞留在生殖道内（滞卵或滞产），而在卵胎生或胎生种类中，生殖道内可能会出现未受精的卵或胎儿。在某些情况下，也可能存在异常的卵巢卵泡。难产通常不像哺乳动物或鸟类那样是一个突发事件，爬行动物可能会在正常产卵/出生时间后几周甚至几个月仍滞留卵或胎儿。如果不知道爬行动物是何时交配的，在其他方面临床健康的爬行动物中，可能很难区分正常妊娠与难产。代谢性疾病或感染会使病情恶化。通常，兽医在对爬行动物进行检查并进行 X 线和超声检查后就能做出诊断。血液检测也有助于识别感染或代谢性疾病，例如高钙血症（血液中钙水平升高；参见营养需求）。
除非有短期疾病的证据，否则可以尝试内科治疗，尽管这种治疗经常失败。改善饲养条件（特别是提供独立的空间和合适的垫料）、纠正任何代谢性疾病以及诱发分娩的激素治疗可能会有所帮助。在大多数情况下，在药物稳定病情后需要进行手术，并且通常需要切除生殖器官。
泄殖腔脱垂
几个器官，包括泄殖腔、结肠、输卵管（雌性生殖道的一部分）、半阴茎/阴茎（类似于雄性哺乳动物的阴茎），以及（在某些种类中如果存在）膀胱，可能会异常地从爬行动物的泄殖腔孔突出并卡在体外。常见原因包括难产、交配创伤、泄殖腔炎症、感染、代谢性疾病、膀胱结石、肾脏疾病、癌症，或腹部任何导致排便时用力的占位性肿块。兽医识别出脱垂的器官非常重要，因为有些器官（例如，龟的阴茎/蛇和蜥蜴的半阴茎，仅用于繁殖而非排尿）可以被切除，而其他器官（例如，泄殖腔、结肠、膀胱）则不能。兽医将温和地清洁脱垂的器官，并试图将其放回体内正常位置。然而，确定病因以防止复发也很重要。
半阴茎和阴茎的脱垂可以通过外科手术截除；这会使动物失去生育能力。如果脱垂的组织有活力并且可以放回体内正常位置，则可以进行手术将其固定在通常的位置。如果组织已经坏死，则需要进行细致的手术以切除受影响的组织并在两端重新连接存活的切段。
爬行动物的皮肤疾病
爬行动物容易患各种皮肤疾病。良好的卫生习惯，例如定期清洁饲养箱、提供新鲜水以及清除未吃完的食物，有助于预防侵染和寄生虫侵袭。
脓肿
脓肿是充满脓液的疮，通常伴有炎症，通常由细菌感染引起。它们见于所有目的爬行动物中。脓肿通常由咬伤、其他损伤或不良环境条件引起。皮下脓肿表现为小肿块或肿胀。其他可能看起来像脓肿的情况包括寄生虫感染、肿瘤和血肿（充满血液的肿胀）。爬行动物的脓肿中可能存在多种细菌，通常一次不止一种。小的局限性脓肿应通过手术切除，以避免频繁复发。较大的脓肿应通过手术切开并引流。可能需要使用合适的抗生素。
皮肤癣菌病
皮肤癣菌病 (Dermatophytosis) 是一种皮肤或爪子的真菌感染，在所有爬行动物中均有描述。在大多数情况下，皮肤损伤为真菌提供了侵入点。患有龟甲真菌感染的龟类可以通过去除坏死、受损或感染的组织并涂抹消毒溶液来治疗。可以口服抗真菌药物或使用局部抗真菌乳膏来治疗皮肤感染。接触紫外线也可能是有益的。（另见下方 See also heading on page 由真菌引起的疾病）
蜕皮障碍
蜕皮不全，蛇
蜕皮障碍是指皮肤蜕皮不完全或异常。低湿度、皮肤寄生虫、营养缺乏、传染病、缺乏合适的粗糙表面以及甲状腺功能下降可能会导致蜕皮异常。眼鳞（眼盖，即眼睛上透明的保护层）或环绕尾巴或脚趾的皮肤带可能无法正常脱落并可能滞留。滞留的眼鳞最好通过连续几天涂抹眼药膏来治疗，直到眼鳞自行脱落或可以用精细镊子小心轻柔地取下。请耐心等待；由于可能会损伤下方的新眼盖，切勿强行剥离眼盖。
滞留皮肤的最佳治疗方法是将爬行动物浸泡在温水（25°C 至 29°C）中几个小时，然后用纱布海绵轻轻拉扯滞留的皮肤。湿度箱也效果很好。这可以很简单，比如一个 10 加仑的鱼缸，里面配有水箱底加热器，并放置湿浴巾。顶部可以用轻薄的布盖住以增加湿度水平，但必须避免过热，可以通过增加通风来缓解过热。预防异常蜕皮比治疗更容易，因此请确保爬行动物没有疾病和寄生虫，饮食适合其种类，饲养在正确的湿度水平下，并提供粗糙的表面以帮助其蜕皮。
皮肤寄生虫
生活在皮肤上的寄生虫可能是野生捕获和新获得的爬行动物的一个问题。对于所有新引入饲养群的动物，通过全面检查并实施一段时间的隔离检疫，是预防寄生虫侵染的最佳手段。
螨虫分布于世界各地，大多数爬行动物种类都会受到影响。螨虫会导致精力下降，在严重侵染时，还会因贫血（红细胞丢失）而导致死亡。螨虫还可能传播来自其他受感染动物的致病生物体。受影响爬行动物的皮肤显得粗糙，并且可能会发生蜕皮障碍。大多数螨虫体型极小（长不到 1.5 mm），经常在眼睛周围、面部或颈部的皮肤褶皱或身体的任何其他凹陷处发现。
肉眼可以看到螨虫，但数量较少时很难看到。如果怀疑有螨虫，将爬行动物放在一张白纸上并轻轻摩擦可能会导致螨虫掉落并显现出来。受影响的爬行动物通常会花大量时间浸泡在水中以淹死螨虫。如果您检查水盆，您可能会看到被淹死的螨虫残骸。
有许多治疗方法。在所有情况下，都应彻底清洁笼子，并且您应该扔掉垫料、树枝和一次性笼具。在治疗完成之前应使用报纸作为垫料，以便于经常清理并消除螨虫产卵的场所。兽医可以告知爬行动物所感染的螨虫类型，并就如何从宠物及其饲养箱中清除螨虫提供建议（例如推荐安全的杀虫剂）。
使用杀虫剂的任何饲养箱都应保持良好的通风，喷洒杀虫剂时应移走所有水容器，待喷雾干燥后再放回。切勿在未咨询兽医的情况下使用任何产品；某些产品对所有爬行动物并非都是安全的。
经常在爬行动物身上发现蜱虫，后者与许多疾病有关。严重侵染可能会因失血导致贫血（红细胞过少）。某些蜱虫可能会引起瘫痪，并伴有咬伤部位的肌肉萎缩。可以使用钳子（镊子）移除蜱虫，或者使用兽医推荐的杀虫剂将其杀死。如果手动移除蜱虫，请佩戴手套，以避免接触其可能携带的疾病。带有蜱虫的动物可能需要抗生素治疗，以治疗与多处皮肤咬伤相关的感染，以及可能由致病细菌传播所引发的疾病。
曾在各种龟类和鳄鱼的腿部、头部、颈部以及口腔中发现水蛭。少量水蛭可能无害，但数量较多可能会引起皮肤损伤并传播其他疾病。可以通过用镊子轻轻将其提起（注意不要损伤下方皮肤）或在其身上倒盐水（可能导致其脱落）来将其移除。
龟经常会有 皮肤蝇蛆。皮蝇会制造皮肤伤口并在其中产卵。虫卵孵化成蛆（幼虫或蝇蛆），生活在类似囊肿的结构中，直到成熟到足以离开伤口。这些伤口通常类似于皮下肿块。这些肿块有一个微小的开口，内部可能覆盖有黑色结痂物质。兽医可以通过稍微扩开开口并用镊子小心地取出蝇蛆来将其移除。然后用消毒溶液冲洗伤口，并涂抹抗生素软膏。有多个伤口的爬行动物通常需要抗生素治疗。现有伤口中也可能发现皮肤蝇蛆。在这种情况下，必须手动清除蝇蛆，并根据需要用抗生素治疗动物。在苍蝇高发季节，建议将龟类养在室内或在饲养箱上加盖纱网以提供一些保护。
鳞片腐烂病
鳞片腐烂病（溃疡性或坏死性皮炎）常见于蛇类和蜥蜴。湿度和不洁净的环境似乎是引起该病的主要因素。潮湿、受污染的垫料会使细菌和真菌大量繁殖。若同时伴有粪便污染，这些生物体会导致皮肤溃疡。如果不加以治疗，其他细菌的继发感染可能导致败血症（血液感染）和死亡。皮肤发红、皮肤坏死区、皮肤溃疡和皮肤分泌物是常见的体征。尽管溃疡有时是由皮肤外伤引起的，但它们更常见于体内发展然后才在皮肤上显现出来。球蟒的经典坏死性皮炎就是这种情况，即使在理想条件下饲养动物也可能发生。该病始于鳞片内出血，随后出现脓疱（类似于青春痘的小型隆起、充满脓液的肿块），最终进展为溃疡。抗生素治疗和良好的卫生条件至关重要。
水疱病是鳞片腐烂病的早期阶段。皮肤会产生脓疱或水疱，如果及早开始治疗，这些脓疱或水疱可能会痊愈而不会发展为溃疡。低度热损伤如果引起充满液体的水疱，看起来可能像水疱病。
败血性皮肤溃疡病
败血性皮肤溃疡病 (SCUD) 是水生龟类的一种细菌感染。该病会导致龟壳上的盾片出现凹陷。盾片可能会脱落，并且可能存在下方的脓性分泌物。可能会出现食欲不振、缺乏活力以及龟壳上出现小红点（因出血引起）。肝损伤很常见。建议使用抗生素治疗。良好的卫生条件对于预防败血性皮肤溃疡病至关重要。
龟壳病与鳞片腐烂病
甲壳动物菌血症
龟类的另一种龟壳病是由壳食贝内克氏菌 (Beneckea chitinovora) 引起的，这是一种常见于甲壳动物（如小龙虾和螃蟹等水生生物）中的细菌。可见龟壳发红、出现凹陷和溃疡。败血症（血液中存在细菌）并不常见。建议使用抗生素和局部碘剂治疗。喂食小龙虾给龟类通常是导致该病情的原因，应予以避免。
影响爬行动物多个身体系统的疾病
在单个动物中影响一个以上身体系统的疾病也称为全身性疾病。
细菌感染
细菌性疾病在所有爬行动物中都很常见。大多数感染发生在免疫系统因疾病或其他原因而减弱的爬行动物中。确定涉及的细菌类型以及纠正导致健康状况不佳的环境和营养缺陷非常重要。除非同时纠正营养、环境和卫生条件，否则抗生素治疗不会成功。
球虫生物体
球虫是微小的寄生虫。据报道，有几种球虫生物体会引起爬行动物患病。疾病的严重程度随球虫生物体的种类和受影响的爬行动物类型而异。这些寄生虫的数量会急剧增加，特别是在免疫系统受抑制的爬行动物中。这些寄生虫的虫卵可以在环境中存活数周。有必要进行彻底的每日清洁，以清除所有粪便以及受污染的食物和水。必须每天清除昆虫和其他食物，因为它们可能是污染源（例如，蟋蟀在从粪便中摄取液体时可能会吃掉寄生虫卵）。使用抗微生物药物治疗可能需要 2 至 4 周。即使在最佳条件下，治疗也只能在 50% 的病例中消除这些生物体。然而，减少这些生物体的数量对于减轻感染的影响并降低向其他动物传播的风险非常重要。
由真菌引起的疾病
过高的湿度、较低的环境温度、现有疾病、营养不良和其他应激源可能会使爬行动物更容易患上真菌病。人们对长期发展并影响全身的真菌感染病程知之甚少，但保持良好的卫生和营养可降低这些感染的发生频率。抗真菌药物可用于治疗已扩散至全身的真菌感染，但爬行动物治疗成功的报道很少。对于局限于一个区域的真菌感染，手术切除受感染组织并进行局部伤口治疗可能会有帮助。在健康爬行动物的粪便中发现了可引起哺乳动物疾病的蛙粪霉属 (Basidiobolus) 菌类。
爬行动物真菌感染最常发生的部位是皮肤和呼吸道。胃肠道组织上发生的愈合缓慢的体内溃疡已与某些真菌感染相关联。真菌感染还可引起肝脏、肾脏和脾脏疾病。在死亡之前，除了体重减轻外，几乎看不到其他体征。动物可能会继续进食，直到死亡前几天。
鞭毛虫
鞭毛虫（一种原虫微生物），尤其是六鞭毛虫属 (Hexamita) 种类，可引起龟类的泌尿道疾病以及蛇类的肠道疾病。通常开具驱虫药或抗原虫药进行治疗。
疱疹病毒
在淡水龟、陆龟和绿海龟中已发现疱疹病毒。在淡水龟中，该病毒可能会影响肝脏。在陆龟中，感染可能会破坏口腔组织，并导致食欲不振、反流，以及口腔和眼睛流出分泌物。
陆龟的治疗包括隔离动物、提供支持性护理以及将抗病毒药物涂抹于病变部位。
蟒蚺包涵体病
红尾蚺和几种蟒蛇最常受由逆转录病毒或沙粒病毒引起的包涵体病影响。蚺被认为是该病毒的典型宿主，因为许多蚺受到感染，并且它们可以在没有体征的情况下携带该病毒多年。在每一只生病的蚺中都应考虑包涵体病的可能性。该病因特征性的包涵体而得名，包涵体是在感染动物的细胞内形成的蛋白质或其他物质的微观团块。包涵体病的体征可能与影响免疫系统的任何因素有关，包括食欲或体重下降、继发性细菌感染、伤口愈合不良和反流。随着病情进展，一些蚺会表现出神经系统体征，例如面部抽搐、异常吐舌、观星症、身体扭曲和癫痫发作。
人们认为蟒蛇是该病毒的非正常宿主，因为它们的病程更严重，神经系统体征更极端。尽管活动性疾病可以在蚺体内持续数月或更长时间，但大多数蟒蛇在出现体征后数天或数周内死亡。
这种感染似乎是通过体液传播的。繁殖、打斗伤口以及动物粪便接触口腔造成的污染（粪口传播）是传播病毒的常见途径。
包涵体病是无法治愈的，许多宠物主人可能会选择对患病的蛇实施安乐死。然而，可以对蛇进行隔离并采取支持性治疗措施。切记不要出售受感染的标本或其后代；这种做法已导致该疾病在世界范围内传播。
传染性泄殖腔炎
泄殖腔（爬行动物排泄尿液和粪便的通道）感染可能是由肾结石或下肠道、泌尿道或生殖道中滞留的其他物质（如滞留的卵或异常矿物质沉积物）引起的。其特征是泄殖腔肿胀和血性分泌物。当饮食中存在维生素或矿物质失衡时，可能会形成矿物质沉积物。这些沉积物应由兽医进行手工清除，随后进行饮食调整。泄殖腔周围的脓肿可蔓延至身体的其他部位，并可引起泌尿道或生殖道感染。需要进行及时且彻底的治疗，包括手术切除受损组织、局部伤口处理以及适当的抗生素治疗。兽医可能需要检查爬行动物的粪便，以确定感染是否由寄生虫引起。
内部脓肿
内脏器官中的脓肿可能是由血液感染（败血症）引起的。雌性生殖系统的脓肿很常见，并可能导致腹腔感染。在这种情况下，由于单独使用抗生素治疗很少成功，因此必须进行手术。
体内寄生虫
致病性扁形虫（吸虫）会感染龟类的动脉和静脉，以及蛇的口腔、呼吸系统和泌尿系统。兽医可以开具抗寄生虫药物来治疗扁形虫感染。
绦虫见于所有目的爬行动物，但在鳄类中较少见。绦虫复杂的生命周期以及对中间宿主的需求限制了圈养爬行动物中的病例数量。当存在时，可能会在泄殖腔中发现绦虫节片（虫体碎片），或者在粪便中发现绦虫卵。某些绦虫的感染性幼虫可能会引起皮下组织的肿胀。其幼虫阶段可通过外科手术摘除。兽医可以开具适当的抗寄生虫药物来治疗绦虫感染。
蛔虫（线虫）见于所有目的爬行动物中。线虫的例子包括蛲虫和钩虫。这些寄生虫可以寄生在爬行动物的肠道、呼吸道或体壁中。有时在粪便中可以发现它们。感染通常较轻微，但也可能导致更严重的疾病，例如肺炎。在严重的情况下，可能会导致死亡。
某些圆虫幼虫可能能够穿透皮肤。清除环境中寄生虫的良好卫生习惯有助于减少圈养爬行动物中的寄生虫负荷。兽医可以开具适当的抗寄生虫药物来治疗圆虫感染。
由旋尾线虫（龙线虫属）引起的皮肤溃疡可能会发生在爬行动物身上。多种旋尾线虫会感染体腔和血管。这些蠕虫在人工繁殖的爬行动物或长期圈养的爬行动物中较少见。为了治疗旋尾线虫感染，兽医可能会建议提高爬行动物的栖息地温度并给予适当的抗寄生虫药物。
舌形虫（五口虫）见于多种爬行动物中。这些虫可能会也可能不会引起疾病体征。感染有时与肺炎体征相关，但这些寄生虫可以寄生在任何组织中，并且体征会根据其穿过组织的迁移路径而有所不同。舌形虫最初在有毒热带蛇类中被发现，在其他爬行动物中也有所见。使用常规药物（驱虫药）治疗通常无法消除这些虫。在某些情况下，兽医可能会使用内镜来定位并机械移除所有成虫。识别这些侵染非常重要，因为人们认为舌形虫会对人类构成侵染风险。
分枝杆菌感染
分枝杆菌感染通常与慢性消瘦（身体逐渐消瘦）有关。这些感染通常会影响龟类的肺部。蜥蜴、蛇和鳄鱼的内脏器官上通常会长出小型赘生物。对抗这些感染所需的药物会损害爬行动物的肝脏，其长期使用不太可能是安全的。
爬行动物的癌症和肿瘤
肿瘤在爬行动物中比以前认为的要常见得多。除了自发发展的癌症（肿瘤性）疾病外，肿瘤还与寄生虫和某些病毒有关。爬行动物中的肿瘤通常很容易通过兽医进行的各种检查来识别。一旦识别出肿瘤，就可以调整采用与其他动物类似的治疗方案。兽医将能够推荐适当的治疗方法。
逆转录病毒
在罗素蝰蛇、玉米蛇和加州王蛇中发现的逆转录病毒有时可能与恶性肿瘤相关。治疗通常包括手术切除肿瘤。
乳头状瘤
欧洲绿蜥蜴似乎通过咬伤将病毒颗粒从一只蜥蜴传播给另一只蜥蜴。由此产生的乳头状瘤（小型赘生物）直径约为 2 至 20 mm，可以是单个的也可以是多发的。尽管在初期阶段没有体征，但受影响的蜥蜴可能会失去精力和食欲并死亡。单个肿块可以通过手术切除，但复发很常见。隔离受影响的蜥蜴可能是防止传播的唯一方法。
一种乳头状瘤样病毒似乎也会影响玻利维亚侧颈龟，并在头部表现为白色、卵圆形的皮肤溃疡。也会出现甲壳溃疡，主要见于甲壳的下部。治疗为支持性护理；受影响的龟应与其他龟隔离。
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另请参阅有关爬行动物疾病的专业内容。
