新引进的非人灵长类动物通常携带大量寄生虫。其中部分属于共栖寄生虫；另一些则可通过严格的卫生措施和良好的饲养管理得到控制。然而，部分寄生虫可导致严重疾病或消瘦，应给予针对性治疗予以清除。
室内饲养（即与饲养人员共同生活）的人工繁育新大陆灵长类动物极少检出肠道寄生虫感染。然而，经常接触沙坑或各种室外围栏设施时，则未必如此。粪便检查应作为常规临床检查的一部分。
非人灵长类动物的节肢动物感染
肺螨病（肺螨属，Pneumonyssus）常见于野外捕获的亚洲和非洲灵长类动物，尤其是恒河猴和狒狒。在实验室饲养或私人圈养的非人灵长类动物中，这种感染较为罕见。
肺螨属的生活史尚不完全清楚。感染通常不会引起严重的临床症状，但可导致打喷嚏和咳嗽。其病变包括终末细支气管的扩张和局灶性慢性炎症。在 X 光检查中，这些病变偶可与结核性肉芽肿相混淆。
伊维菌素（200～500 μg/kg，皮下、口服或肌内注射，单次给药，必要时每 14 天重复一次）已用于治疗封闭繁殖群中肺螨属感染。
疥螨（Psorergates spp, Sarcoptes scabiei）或吸血虱（如钝形猿虱，Pedicinus obtusus）偶见于非人灵长类动物，尤其是野生动物，可引起皮肤病。由于动物之间存在互相梳理毛发的行为，部分动物体外寄生虫不易发现，因此可考虑经验性治疗。建议给予伊维菌素全身治疗（200 μg/kg，口服、皮下或肌内注射，每3周一次），或局部使用莫昔克丁（0.5 mg/kg）或除虫菊素（按产品说明书），必要时于 3 天后重复一次。应避免使用毒性较大的外用杀寄生虫药物，以免动物梳理毛发时误食。
蜱虫可寄生于户外饲养的动物身上。由于非人灵长类动物具有自行清除体外寄生虫的习性，蜱虫较难在其体表被发现，但其仍可像感染人类一样，将莱姆病等疾病传播给非人灵长类。
与环境中犬猫接触的新大陆灵长类动物常可感染跳蚤。应采取环境控制措施，并使用含除虫菊素的洗毛剂为动物洗浴，以暂时清除其被毛中的跳蚤。
非人灵长类动物的蠕虫感染
粪类圆线虫属（Strongyloides）和毛圆线虫属（Trichostrongylus）均属于侵袭性蠕虫。其成虫可引起肠炎和腹泻；幼虫在迁移过程中可引起肺部病变。这些蠕虫以及鞭虫属（Trichuris）可采用噻苯咪唑（100 mg/kg，口服，每 2～4 周一次，直至粪便检查阴性）、伊维菌素（200 μg/kg，皮下注射，单次，14 天后重复一次）或芬苯达唑（50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 5 天，并于 21 天后重复一次）有效治疗。双羟萘酸噻嘧啶（10 mg/kg，口服，单次给药）也是治疗新大陆猴及原猴线虫感染的可选方案。严格落实环境卫生措施可进一步提高驱虫治疗效果。
食道口线虫属（Oesophagostomum）可在大肠壁形成特征性肉芽肿性结节，寄生虫在其中钻入组织、发育，并诱发宿主免疫反应。这些结节可能会破裂并引发腹膜炎。阿苯达唑为首选治疗药物，通常剂量为 7.5 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 3 天。
前睾棘头虫属（Prosthenorchis）是一类棘头虫，常见于中南美洲非人灵长类动物，可钻入回盲部黏膜；大量感染时可导致肠穿孔或肠梗阻。蟑螂是中间宿主，消灭蟑螂并严格保持卫生，对于控制感染至关重要。抗寄生虫治疗通常效果有限。
棘唇线虫属（Dipetalonema）和四瓣丝虫属（Tetrapetalonema）均为寄生于新大陆灵长类动物腹腔内的丝虫。虽然中等数量的虫体可能仅引起非常轻微的宿主反应，但重度感染可导致腹膜炎及消瘦。出现临床症状时，二乙碳酰氨嗪（20～50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，持续 7～21 天）为首选治疗方案。
许多南美猴类常见类丝虫属（Filaroides）等肺线虫感染。一经发现应及时治疗，以预防肺炎、肺瘢痕形成或纤维化，以及其他呼吸系统疾病进一步恶化。二乙碳酰氨嗪（50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 10 天）已被证明有效。
非人灵长类动物中的绦虫和吸虫感染
司氏伯特绦虫（Bertiella studeri）及其他肠道绦虫可见于野生灵长类动物，可采用吡喹酮（5 mg/kg，肌内注射、口服或皮下注射，单次给药）有效治疗。某些绦虫感染需采用更高剂量吡喹酮（15～20 mg/kg，口服或肌内注射，单次给药）。已有躯体幼虫（囊尾蚴型）绦虫感染的报道。
吸虫可引起呼吸道、胃肠道和血液系统症状。血吸虫属（Schistosoma）为血吸虫类吸虫，而片形吸虫属（Fasciola）可引起肝脏疾病及肝脓肿（旧大陆灵长类动物更为常见）。吸虫的中间宿主为螺类和甲壳类动物，非人灵长类动物通过摄入受污染的水或食物而感染。吡喹酮（40 mg/kg，口服或肌内注射，单次给药）治疗有效。
非人灵长类动物中的原虫感染
非人灵长类动物可作为多种肠道阿米巴原虫的宿主。这些原虫是导致非人灵长类动物腹泻和胃肠道不适最常见的寄生虫。
溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica）是非人灵长类动物最主要的致病性阿米巴原虫（与人类的感染情况一致），可导致多种动物发生严重的阿米巴病。溶组织内阿米巴 感染可无临床症状；但溶组织内阿米巴重度感染时可导致严重肠炎和腹泻，粪便中可出现大量包囊。粪便三色染色是诊断此类感染的重要方法，而直接涂片或粪便浮集法检查常易漏诊。
贾第鞭毛虫属（Giardia）寄生于小肠上段，在大多数非人灵长类动物中可引起亚临床感染，或导致浅色或水样腹泻。建议使用甲硝唑（50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 5～10 天）、芬苯达唑（50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 3 天）或替硝唑（50 mg/kg，口服，每 24 小时一次，连续 3 天）进行治疗。
顶复门寄生虫——小隐孢子虫（Cryptosporidium parvum）——也可导致非人灵长类动物腹泻，主要见于幼龄动物。小隐孢子虫感染在免疫功能正常的宿主中通常具有自限性。幼龄动物及免疫功能低下动物可能需要胃肠外补液及支持性治疗。
疟原虫属（Plasmodium）、利什曼原虫属（Leishmania）和锥虫属（Trypanosoma）等血液寄生虫也可感染非人灵长类动物。通常，寄生虫与天然宿主之间处于平衡状态，感染很少引起明显疾病；但严重免疫功能低下动物可发生伴腹水的心肌炎。
虽然猴疟传播给人类较为罕见，但在存在适宜节肢动物媒介的地区，确有此类传播发生。某些非人灵长类物种（例如夜猴）是疟疾研究的绝佳模型。可通过血涂片、血液培养或 PCR 检测鉴定其病原体。目前已有针对克氏锥虫（Trypanosoma cruzi）的血清学检测方法。抗疟药治疗可清除血液循环中的寄生虫，但仍可能发生复燃或再次感染。
自然发生的弓形虫病（弓形虫 [Toxoplasma gondii] 感染）主要见于中美洲和南美洲的非人灵长类动物。该病对松鼠猴属（Saimiri ）和环尾狐猴（Lemur catta）往往具有极高的致死率。弓形虫病临床症状通常缺乏特异性（嗜睡、厌食、腹泻，可伴或不伴呼吸困难），且在动物园或繁殖设施等高密度饲养环境中病情进展迅速。肝脏局灶性坏死和伴有水肿的纤维素性肺炎是常见的组织学病理表现。急性感染病例可在血涂片中检出弓形虫属（Toxoplasma）。
关键点
野外捕获的非人灵长类动物可携带多种寄生虫，其中部分具有人畜共患风险。
所有非人灵长类动物均应定期进行常规粪便检查。
